廣東省微生物研究所前身為中科院中南真菌研究室，于1964年5月19日經國家科委批準成立，1972年改為現名，隸屬于廣東省科學院。2012年4月，在廣東省事業單位分類改革中確定為公益一類事業單位。目前我所在職人員208人，其中專業技術人員172人，博士27人，碩士62人。2005年我所和華南理工大學聯合申報微生物學博士點獲得成功，目前我所與中科院南海海洋研究所、中科院華南植物園、中科院廣州化學研究所、中科院廣州地球化學研究所、華南理工大學、廣東工業大學、暨南大學、華南農業大學、江西農業大學、西南大學、塔里木大學等科研院所和高校聯合培養研究生。至2012年10月，我所有碩士研究生導師13名，其中4名同時為博士研究生導師，共培養了碩士研究生71名，博士研究生34名。我所已建立起較完善的包括研究生教育的人才培養和引進機制，逐步形成層次分明、結構合理、創新能力較強的人才隊伍。

　　2010年，經國家人社部批準建立“廣東省微生物研究所博士后科研工作站”（人社部發〔2010〕60號），與博士后流動站設站單位聯合招收博士后研究人員。我所先后與中科院廣州地球化學研究所博士后流動站和中科院華南植物園簽訂聯合招收博士后研究人員協議。另外我所還可以通過廣東省科學院博士后工作站直接獨立招收博士后研究人員。